MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 295945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022785	GAC	2	6	558	563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683038
2	NC_022785	TGG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683038
3	NC_022785	AGGG	2	8	657	664	25 %	0 %	75 %	0 %	557683038
4	NC_022785	CGG	2	6	682	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
5	NC_022785	TGG	2	6	700	705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683038
6	NC_022785	GCG	2	6	728	733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
7	NC_022785	CGG	2	6	734	739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
8	NC_022785	GCT	2	6	753	758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683038
9	NC_022785	CACG	2	8	847	854	25 %	0 %	25 %	50 %	557683038
10	NC_022785	CGGCG	2	10	868	877	0 %	0 %	60 %	40 %	557683038
11	NC_022785	CG	3	6	920	925	0 %	0 %	50 %	50 %	557683038
12	NC_022785	GAC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683038
13	NC_022785	CGG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
14	NC_022785	GCC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
15	NC_022785	GTCGG	2	10	1373	1382	0 %	20 %	60 %	20 %	557683039
16	NC_022785	AGC	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
17	NC_022785	CAC	3	9	1452	1460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683039
18	NC_022785	GGCG	2	8	1599	1606	0 %	0 %	75 %	25 %	557683039
19	NC_022785	GCA	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
20	NC_022785	GCCGC	2	10	1771	1780	0 %	0 %	40 %	60 %	557683039
21	NC_022785	GGA	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
22	NC_022785	CGGC	2	8	1977	1984	0 %	0 %	50 %	50 %	557683039
23	NC_022785	GCT	2	6	1992	1997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
24	NC_022785	GCT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
25	NC_022785	AGA	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683039
26	NC_022785	GAG	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
27	NC_022785	CCG	3	9	2105	2113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
28	NC_022785	GGA	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
29	NC_022785	CTGC	2	8	2164	2171	0 %	25 %	25 %	50 %	557683039
30	NC_022785	CTC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683039
31	NC_022785	GGA	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
32	NC_022785	GTC	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
33	NC_022785	CCG	2	6	2221	2226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
34	NC_022785	CGG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
35	NC_022785	CGTG	2	8	2352	2359	0 %	25 %	50 %	25 %	557683039
36	NC_022785	TCG	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
37	NC_022785	CG	3	6	2499	2504	0 %	0 %	50 %	50 %	557683039
38	NC_022785	ATC	3	9	2506	2514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683039
39	NC_022785	TCC	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683039
40	NC_022785	AGC	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
41	NC_022785	GCC	2	6	2666	2671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
42	NC_022785	GGA	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
43	NC_022785	TGA	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683039
44	NC_022785	GCA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
45	NC_022785	CGC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
46	NC_022785	CGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
47	NC_022785	TCA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683039
48	NC_022785	CTG	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
49	NC_022785	GC	3	6	2892	2897	0 %	0 %	50 %	50 %	557683039
50	NC_022785	GGTG	2	8	2978	2985	0 %	25 %	75 %	0 %	557683039
51	NC_022785	CAG	2	6	2989	2994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
52	NC_022785	AACTC	2	10	3017	3026	40 %	20 %	0 %	40 %	557683039
53	NC_022785	GCT	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
54	NC_022785	CGC	2	6	3099	3104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
55	NC_022785	GCTCC	2	10	3105	3114	0 %	20 %	20 %	60 %	557683039
56	NC_022785	CGG	2	6	3118	3123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
57	NC_022785	ACC	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683039
58	NC_022785	CGC	2	6	3140	3145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
59	NC_022785	GCGAGG	2	12	3164	3175	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	557683039
60	NC_022785	GGC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
61	NC_022785	GC	3	6	3255	3260	0 %	0 %	50 %	50 %	557683039
62	NC_022785	GGACTG	2	12	3285	3296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557683039
63	NC_022785	TCG	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
64	NC_022785	CGT	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
65	NC_022785	CGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
66	NC_022785	TGGCGG	2	12	3415	3426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	557683039
67	NC_022785	AGC	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
68	NC_022785	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
69	NC_022785	CGA	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
70	NC_022785	GCA	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
71	NC_022785	CA	3	6	3594	3599	50 %	0 %	0 %	50 %	557683039
72	NC_022785	GTGG	2	8	3600	3607	0 %	25 %	75 %	0 %	557683039
73	NC_022785	CG	3	6	3635	3640	0 %	0 %	50 %	50 %	557683039
74	NC_022785	CGC	2	6	3753	3758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
75	NC_022785	AGC	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683040
76	NC_022785	CCCG	2	8	3951	3958	0 %	0 %	25 %	75 %	557683040
77	NC_022785	CCA	2	6	3993	3998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683040
78	NC_022785	GCC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683040
79	NC_022785	GGA	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683040
80	NC_022785	GTGCG	2	10	4228	4237	0 %	20 %	60 %	20 %	557683040
81	NC_022785	GAC	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683040
82	NC_022785	TG	3	6	4332	4337	0 %	50 %	50 %	0 %	557683040
83	NC_022785	GC	3	6	4358	4363	0 %	0 %	50 %	50 %	557683040
84	NC_022785	TGC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683040
85	NC_022785	GCAG	2	8	4770	4777	25 %	0 %	50 %	25 %	557683041
86	NC_022785	GGA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683041
87	NC_022785	CGC	2	6	5258	5263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683042
88	NC_022785	AGC	3	9	5284	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683042
89	NC_022785	GCC	2	6	5344	5349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683042
90	NC_022785	CGT	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683043
91	NC_022785	CGGC	2	8	5468	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	557683043
92	NC_022785	GCG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
93	NC_022785	GGC	2	6	5561	5566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
94	NC_022785	GGGC	2	8	5569	5576	0 %	0 %	75 %	25 %	557683043
95	NC_022785	GCA	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683043
96	NC_022785	GCG	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
97	NC_022785	GGT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
98	NC_022785	GTGG	2	8	5716	5723	0 %	25 %	75 %	0 %	557683043
99	NC_022785	GCA	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683043
100	NC_022785	TCG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683043
101	NC_022785	GCGG	2	8	5794	5801	0 %	0 %	75 %	25 %	557683043
102	NC_022785	GGAG	2	8	5814	5821	25 %	0 %	75 %	0 %	557683043
103	NC_022785	CGC	2	6	5875	5880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683043
104	NC_022785	GT	3	6	5909	5914	0 %	50 %	50 %	0 %	557683043
105	NC_022785	GCC	2	6	5943	5948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683043
106	NC_022785	GAT	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683043
107	NC_022785	GCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
108	NC_022785	CGG	2	6	6051	6056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
109	NC_022785	GGC	2	6	6102	6107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
110	NC_022785	AGT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683043
111	NC_022785	GCGG	2	8	6180	6187	0 %	0 %	75 %	25 %	557683043
112	NC_022785	GGTG	2	8	6204	6211	0 %	25 %	75 %	0 %	557683043
113	NC_022785	GC	3	6	6221	6226	0 %	0 %	50 %	50 %	557683043
114	NC_022785	AGG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683043
115	NC_022785	GCG	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
116	NC_022785	GC	3	6	6269	6274	0 %	0 %	50 %	50 %	557683043
117	NC_022785	GGGCA	2	10	6295	6304	20 %	0 %	60 %	20 %	557683043
118	NC_022785	GGC	2	6	6319	6324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
119	NC_022785	GCC	2	6	6343	6348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683043
120	NC_022785	AAG	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683043
121	NC_022785	TGG	2	6	6420	6425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
122	NC_022785	CGG	2	6	6460	6465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
123	NC_022785	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
124	NC_022785	GGTGTG	2	12	6484	6495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
125	NC_022785	CGT	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683043
126	NC_022785	GCG	2	6	6534	6539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
127	NC_022785	GCG	2	6	6545	6550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
128	NC_022785	TGG	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
129	NC_022785	AGGCG	2	10	6574	6583	20 %	0 %	60 %	20 %	557683044
130	NC_022785	GCA	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
131	NC_022785	GGC	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683044
132	NC_022785	GCG	2	6	6693	6698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683044
133	NC_022785	GTC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683044
134	NC_022785	GTCGGC	2	12	6728	6739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	557683044
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137	NC_022785	GCA	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
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139	NC_022785	CGA	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
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141	NC_022785	TCG	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683044
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259	NC_022785	CGA	2	6	12802	12807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683050
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262	NC_022785	CCG	2	6	12873	12878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683050
263	NC_022785	C	6	6	12915	12920	0 %	0 %	0 %	100 %	557683050
264	NC_022785	GGA	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683050
265	NC_022785	CGA	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683050
266	NC_022785	CGC	2	6	13006	13011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683050
267	NC_022785	GCG	2	6	13016	13021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683050
268	NC_022785	CCTGGT	2	12	13057	13068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683050
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270	NC_022785	C	6	6	13129	13134	0 %	0 %	0 %	100 %	557683050
271	NC_022785	GCC	2	6	13142	13147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683050
272	NC_022785	CGC	2	6	13169	13174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683050
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275	NC_022785	CGA	2	6	13303	13308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683050
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277	NC_022785	CGGAC	2	10	13441	13450	20 %	0 %	40 %	40 %	557683050
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281	NC_022785	CGA	2	6	13540	13545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683050
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283	NC_022785	CGC	2	6	13556	13561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683050
284	NC_022785	CTG	2	6	13577	13582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683050
285	NC_022785	ACT	2	6	13656	13661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683050
286	NC_022785	ACC	2	6	13662	13667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683050
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288	NC_022785	ACA	2	6	13716	13721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557683050
289	NC_022785	CCG	2	6	13722	13727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683050
290	NC_022785	CCA	2	6	13737	13742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683050
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301	NC_022785	CT	3	6	14188	14193	0 %	50 %	0 %	50 %	557683050
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303	NC_022785	GGCCA	2	10	14327	14336	20 %	0 %	40 %	40 %	557683050
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369	NC_022785	TC	3	6	21201	21206	0 %	50 %	0 %	50 %	557683056
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372	NC_022785	TCG	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683057
373	NC_022785	CAT	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683057
374	NC_022785	GGCC	2	8	21384	21391	0 %	0 %	50 %	50 %	557683057
375	NC_022785	TGG	2	6	21392	21397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683057
376	NC_022785	GAT	2	6	21442	21447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683057
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378	NC_022785	CG	4	8	21573	21580	0 %	0 %	50 %	50 %	557683057
379	NC_022785	CGG	2	6	21652	21657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683057
380	NC_022785	GCA	2	6	21690	21695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683057
381	NC_022785	GGTCGC	2	12	21738	21749	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	557683057
382	NC_022785	GTG	2	6	21772	21777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683057
383	NC_022785	CCGT	2	8	21827	21834	0 %	25 %	25 %	50 %	557683057
384	NC_022785	GGC	2	6	21892	21897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683057
385	NC_022785	GGCA	2	8	22964	22971	25 %	0 %	50 %	25 %	557683058
386	NC_022785	CCA	2	6	22977	22982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683058
387	NC_022785	TGG	2	6	23010	23015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683058
388	NC_022785	GCAC	2	8	23022	23029	25 %	0 %	25 %	50 %	557683058
389	NC_022785	AGC	2	6	23048	23053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683058
390	NC_022785	CAC	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683058
391	NC_022785	GCA	3	9	23076	23084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683058
392	NC_022785	CAC	2	6	23089	23094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683058
393	NC_022785	AAC	2	6	24880	24885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557683059
394	NC_022785	GCTG	2	8	24923	24930	0 %	25 %	50 %	25 %	557683059
395	NC_022785	GGCTAC	2	12	24934	24945	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	557683059
396	NC_022785	CGT	2	6	25041	25046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683059
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399	NC_022785	CCT	2	6	25077	25082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683059
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402	NC_022785	ACC	2	6	25188	25193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683059
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411	NC_022785	CAT	2	6	28422	28427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683062
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425	NC_022785	GCTG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	557683063
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453	NC_022785	GAC	3	9	33787	33795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683064
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461	NC_022785	CCG	3	9	37422	37430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683066
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472	NC_022785	CGA	2	6	37884	37889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683066
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495	NC_022785	C	6	6	38920	38925	0 %	0 %	0 %	100 %	557683068
496	NC_022785	GGCT	2	8	38926	38933	0 %	25 %	50 %	25 %	557683068
497	NC_022785	CCG	2	6	38951	38956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683068
498	NC_022785	CGA	2	6	39024	39029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683068
499	NC_022785	CGC	2	6	39206	39211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683069
500	NC_022785	CGGTC	2	10	39239	39248	0 %	20 %	40 %	40 %	557683069

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